免疫系統概分為先天免疫與後天免疫兩種。

大部分生物，包括動、植物、真菌和昆蟲，都只具有先天免疫， 唯有有頷脊椎動物，如人類，才同時擁有這兩道防線。

物理屏障是免疫系統的第一道關卡， 體表的皮膚、黏液和酵素會排除大部分入侵的微生物。 當少量微生物通過這些屏障時，人體開始啟動局部的先天免疫，產生發炎反應。 負責吞噬或毒殺微生物的巨噬細胞、多形核白血球及自然殺手細胞等免疫細胞， 浸潤至發炎部位，開啟戰爭。特定免疫細胞會接著分泌趨化素， 號召更多的白血球加入戰局。

除了免疫細胞發動攻擊外，體液中的補體也開始活化並攻擊病菌。 先天免疫作為第一道防線，禦敵反應快速， 但不具專一性，沒有辦法提供持久性的保護力。 人們總會將免疫力差與身體不好畫上等號，的確免疫力低下容易讓細菌、病毒有機可趁，但像「自體免疫疾病」、「過敏」卻恰恰相反， 是由於免疫力太高而引發的問題！

為什麼免疫力太高也會讓身體出狀況呢？

康普頓陳醫師將免疫系統比喻為蹺蹺板， 兩端分別是 TH1 跟 TH2 兩種免疫細胞， 在身體健康的狀態下，兩者會維持平衡； 一旦天平傾斜，身體的毛病就隨之而來。 當 TH1 活性過高，不僅會對入侵的病菌啟動免疫反應， 還會攻擊周遭身體細胞，變成「誤殺友軍」的尷尬情況， 引發「自體免疫疾病」（如紅斑性狼瘡、第一型糖尿病、乾癬等）。

假使 TH2 活性太高，會將原本無害的物質誤判具威脅性， 進而釋出抗組織胺導致身體紅腫、發炎充血， 像常見的異位性皮膚炎、過敏性鼻炎、氣喘等， 都是 TH2 免疫細胞疑心病太重造成的過度反應。 跟蹺蹺板的原理一樣，當其中一方的活性太高，另一方的能力就會降低， 例如 TH2 太過活躍，那負責抵抗病菌的 TH1 便被抑制， 長久下來得到其他疾病的機會也變大。

康普頓陳醫師總結：

「維持免疫平衡才是健康之道，過度提升免疫力反而弄巧成拙。」

陳醫師點出最主要的原因和遺傳有關， 除了先天因素之外，臨床上很常碰到身處高壓情況、 或是環境改變而引起的免疫失調（例如換工作、大考、遭逢劇變等）， 常常在身處壓力之中沒事，等到高壓狀況解除， 身體所承受的負面壓力立刻反噬， 所以才會有不少人在忙完工作或考試後就立刻掛病號。

陳醫師特別提醒，如果本身已經確診有免疫失調相關疾病的患者， 要注意不要讓情緒起伏過大。 當先天免疫系統無法完全消滅侵入者時，後天免疫系統便會開始啟動應戰。 相較於先天免疫為無差別攻擊，後天免疫具專一性，可針對特定病原體啟動免疫反應將之殺滅。

先天免疫的白血球及自然殺手細胞將病原體吞噬， 並將侵入物訊息(抗原,antigen)直接或間接透過抗原呈現細胞， 如樹突細胞 (Dendritic cells)，提供給後天免疫系統， 以活化具專一性的T和B淋巴細胞。 它們會根據有吞噬能力的白血球所提供的情報， 了解病原體的特質，再針對病原體本身發展出更厲害的攻擊武器。 B淋巴細胞會分泌專門對付這個病原體的抗體， 進行中和、調理病原體等作用，使病原體更容易被免疫系統滅除。 T細胞分為兩型，輔助型T細胞協助B淋巴細胞產生辨認微生物表面各種抗原的抗體，殺手型T細胞則藉著辨認病毒的抗原來殺死已被病毒感染的細胞。

後天免疫具有專一性和記憶性，當下次相同病原體侵入身體時， 就會直接由後天免疫執行防衛，迅速展開專一性攻擊。